Fakültemiz Bakanlar Kurulunca 24.10.2001 tarihinde kurulmuş olup 2002-2003 Eğitim-öğretim yılında 31 öğrenci ile eğitime başlamıştır. Fakültemizde 3 bölüm, 8 Ana Bilim Dalı,
8 öğrenci laboratuvarı ve 2 araştırma laboratuvarı bulunmaktadır. Laboratuvarlarımız gelişmiş teknolojiye sahip cihazlarla (GC, HPLC, UV spektrofotometre vd.) donatılmış olup ileri araştırmalar için üniversitemizin Merkezi Araştırma Laboratuvarı’ndan yararlanılabilmektedir. Ayrıca, ağırlıklı olarak tıbbi bitkilerin bulunduğu, İnönü Üniversitesi Eczacılık Fakültesi Herbaryumu (INUE) oluşturma çalışmaları sürmektedir.